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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已显视出大面积的生物体活性酶类，有抗恶性肿瘤和抗病性毒效果。基本上，三萜是完成甲羟戊酸路线分解的，并从本身沉水植物和细菌中提现。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上发布了一篇“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的分析方案论文怎么写。该分析方案挖掘三萜类单质虫草酸（GA）是进行溶液激发的无柄虫草菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的微生物制品流量转化引起的。采用转录组和球膳食纤维组学的技能进一次研究无柄野生灵芝粉菌丝体中DHT引起五种野生灵芝粉酸（GA）的新机制，并不同两组学的技能检查测量到的距离人类基因和距离球淀粉酶，推断出DHT 微生物制品提炼 GA 的有效途径。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录混合物析和实用功能总类

顺利通过对无柄野生灵芝真菌感染菌丝体通过转录组测序共得到了67230个转录本和142915个单遗传遗传基因遗传。在以上单遗传遗传基因遗传中，49两个被技术鉴定为文化差异表现遗传遗传基因遗传（DEGs），在这中仅213个表现上涨，279个表现下跌（图1A）。GO聚集数据分析一下后，DEGs分类生物制品步骤（BP）、肿瘤细胞系含量（CC）和团伙作用（MF）3类。在BP行业门类中，现身了前四个子行业门类：抗生素类分解掉分解步骤，乙酸盐分解步骤和甲酸盐分解步骤;而在CC行业门类中，肿瘤细胞系外区、突触包覆体、突触架构是前四个亚类。相对于MF行业门类，甲酸脱氢酶（NAD）渗透性酶类、空气氧化复原酶渗透性酶类和酸氨（或酰胺）无线连接酶渗透性酶类是前四个亚行业门类（图1B）。在DEGs的KEGG环路数据分析一下中，前30条聚集度高达的环路含有27条应归分解，在这中仅二氧化氮分解、乙醛酸盐和二羧酸盐分解、丙酸盐分解卫星信号环路正相关聚集（图1D）。

图1|转录成分析和能力分为

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

经过对无柄野生灵芝真菌感染菌丝体完成淀粉酶质组学探讨，共分确实了16,457种多样肽、2606种淀粉酶质和2588种按量淀粉酶质。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的建立环境下，来到2606种淀粉酶质中，94种被鉴别为性别区别表达出来方式淀粉酶（DEPs），但其中的52种调整，42种下跌（图2A），图2C体现了性别区别表达出来方式淀粉酶的聚类算法探讨热图。从GO探讨来，BP专业类别体现，大多都数DEPs加入乙酸盐基础消化吸收具体步骤、消炎药化解基础消化吸收具体步骤和用药化解基础消化吸收具体步骤。CC类DEPs在神经受损人体细胞系外区、过腐蚀物酶体和微体中比率最快，腐蚀保存酶活力和甲酸脱氢酶（NAD）活力在MF类中DEPs的比例图最快（图2B）。与转录组结局类似，KEGG卫星信号环路探讨体现，众多DEPs在基础消化吸收中聚集，但其中的3条最聚集的条件是光合动物中的碳特定、碳基础消化吸收和MAPK卫星信号卫星信号环路（图2D）。除此之外，经过探讨GO的数据库系统的CC对DEPs完成亚神经受损人体细胞系标记探讨和注脚（图2E），DEPs重要规划在神经受损人体细胞系质（40.66%）、神经受损人体细胞系膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），基础理论上是GAs动物结合的重要座位。

图2|蛋清质组的化学发光法分析一下和模块手机验证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

糊口物转成和相较比较组得票数DEGs和DEPs设计了维恩图，有20个不同之处表述染色体（图3A）。对转录组和核氨基酸组中E组和C组总共的DEGs/DEPs进行聚类概述概述，得知mRNA和核氨基酸相互相互有1五个调涨染色体和五个变动染色体，DEGs与之翻译英语的DEPs表述平行呈正相应，通过Pearson的相应指数公式概述，在转录组和核氨基酸组相互相互检验到对较高的相应性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）的检测的但是呈现，E组和C组15个DEGs的抒发品质不统一性更为明显，在这其中9个为上涨DEGs，1个为变动DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的抒发发展与转录类物质析的但是统一。

图3|球胆固醇组的定量研究研究和能力检验

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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