
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探讨结局
分析工作人员研究性渐渐食品冷冻箱时长间隔变长鸡肉的硬性、持水力发电、光亮度、散布铁含氧量、ROS、脂质过被氧化物质、MDA、GSH和GPX4含氧量来测试肌肤团体细胞核膜的铁死亡视频壮态。效果体现 ,食品冷冻箱时长间隔变长后,鸡肉的硬性在第5天和第6天相关系数走低;持水的能力变低;颜色图片变深,丧失光亮,鲜颜色就来为暗颜色。不仅,散布铁、活性酶类氧和MDA的含氧量相关系数不断增加,细胞核膜凋亡率相关系数增加。 调查人员管理分离出来不一样的食品冷藏日子的手臂胸肌试样的球营养物质,但是做出SDS-PAGE数据浅析,球营养物质条带在不一样的时间段分布区均且一样(图1a)。只能根据球核核蛋白在不一样的试样中的呈现前提,数据浅析发现同个组试样的中六位数表示于同个横向(图1b),解释手臂胸肌试样球营养物质有着很好的组内一样性和组间之间的关系性。 血清质组学共技术检验费出1996种血清质。以B0为比对组,挑选B1、B2、B4和B6中的血清参与相互影响体现技术分享,共技术检验费到376个DEPs。将火山图信息可视化,并表明FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05三个标准化分享DEP。报告单如同1c-f图示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别技术检验费出22、33、73和140个DEPs,在这其中分刘海别上浮6、11、32和83个,再降16、22、41和55个。聚类分析法技术评估报告格式了其他速冻关键时期身体背部肌肉组织开展中血清质的体现技术,报告单出现身体背部肌肉血清体现技术相互影响随保存时期的不断增高而不断增高(图1g)。
图1| 差异冷冻准确时间的背部肌肉原材料蛋白质含量质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各不相同保温时间间隔的相关肌肉合格品不同之处血清数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁致死蛋白酶肽的PRM降钙素原检测剖析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG丰度一定的差异展现血清的铁自杀缘由(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT酶联免疫法核蛋白酶质组学技巧设备保障,拜谱微生物已创新提交并组建了建立完善旺盛期的转录组学、核蛋白酶组学、细胞代谢组学包括两组学联动护肤品技巧设备保障制度,欢迎致电咨询!
参考资料论文参考文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.